在一个架空世界里，有一小群秘密存在着的“特殊能力者”，简称特能人。他们不会在普通人面前暴露自己，并通过一个自治组织——异控局，对各种特能造成的非自然事件进行管理，维护社会秩序。然而随着时间推移，特能人之间也出现了立场分化。有人想要守护和平维持平衡，有人想利用特能攫取私利。矛盾，一触即发。
全国大赛开幕在即，渴望一鸣惊人的樱木花道却因为底子太薄，连续三次被赶出球场，且一分未得。即使在晴朗明媚的日子里，樱木的心情也超级差，连续对他的死党和任何挡在面前找麻烦的人使出头槌。他希望私下里请木暮帮他集训，又不愿让大猩猩知道。当他和伙伴们路过某个球场时，刚好看到赤木晴 子在这里练习投球。就在此时，一台机车飞驰冲入球场，头戴安全帽的骑手腾空而起，绝杀灌篮。此人是津久武高中篮球部一年级新生南乡桄一郎，他不仅对樱木的头槌无动于衷，更具有令众人无法轻视的实力。接下来一场，湘北篮球队遇上了强劲对手津久武…… 本片根据井上雄彦的同名漫画改编，为该动画的第二部剧场版。
五千年前，对于修行有着无数憧憬的少年，却因体质特殊而无法突破炼体期，进入下一个修炼境界。他从远古神话时代一直修炼到了现代社会，站在繁华都市中，炼体期九万九千四百四十二层的轩辕铭。给自己定了一个小目标：先修炼到炼体期十万层
