故事主要讲述，在一个顶级机密的军事实验室里，一群智力超群的年轻科学家偶然间揭开了人体隐形的秘密。他们的领队塞巴斯蒂安平日里骄傲自大，一意孤行。这次不顾生命安危和同事的劝阻，执意要拿自己的身体做试验品。当同事们成功将他变成隐形人后，却发现不能将他还原。 　　正当同事们为找到还原方法没日没夜工作时，塞巴斯蒂安的身体和思想却发生了他们意想不到的变化。他越来越觉得隐形人好处多多，不愿意再回到从前的自我。

本片改编自真人真事。一名乡下老师在1925年遭警方拘捕，因为他违反了当时的法律禁令，在课堂上公开讲授达尔文的“进化论"。此事在平静的南方小镇此起轰动，两位顶尖的律师各据一方代表正反两面互相抗辩，等于人类直接向上帝的权威挑战。