解放前，黄土高原上的阎家寨以炮仗出名，这里制作的炮仗经销全国。阎家寨里居住着宋、阎两族人，两族人之间一直就摩擦不断，由于閻姓掌握着这里炮仗生意，所以在阎族人在这里还是稍占上风。这天，宋东升（陈豪 饰）因为和当地的寡妇互生情愫，准备逃走时被族人捉住，由这里的主事人阎家族长阎万熙（林保怡 饰）主持执行家法。东升看着情人被活活烧死，而他也被缠上长长的炮仗被执行“点天灯”。东升侥幸逃过一死，被赶出了阎家寨，勒令以后永远不准回来。情人的惨死在东升心里埋下了仇恨的种子，他决定有朝一日一定要再次回来为死去的情人复仇。 一晃两年过去了，时局发生了很大的动荡，阎家寨这个高原上的寨子似乎还保持着往日的平静。只是，东升回来了……
图书管理员林玉莲（谢仙 饰）和毕业生李世林（高鑫 饰）真心相爱，但由于世林在老家有童养媳巧芳，导致了一系列问题。李世林的父亲责打了他，而巧芳为保护丈夫挨了李父一棍，受伤严重，需要送往日本救治。这一系列的事件为故事奠定了悲剧的基调。 在巧芳伤愈后，她却丧失了生育能力。于是，李家支付重金向玉莲的哥哥明辉购买了孩子，并希望明辉能够促使玉莲尽快改嫁。在明辉的压力下，玉莲最终嫁给了世林的老同学于伟。然而，于伟的母亲得知玉莲有一个7岁大的孩子后，非常生气地将玉莲赶出家门。然而，在于伟被烧伤之后，以及明辉深陷矿难之后，世林和玉莲选择放下过去的恩怨，用博爱之心施以援手。
李时珍（林文龙 饰）自由沉迷于草药研究之中，他同名为吴慕榕（李诗韵 饰）的女子先前已有婚约，却无法自持的爱上了善良美丽的阿冬（叶璇 饰）。李时珍决定将这份感情埋藏在心底，待科举考试之后向阿冬表白心意，哪知道在阴差阳错之中，他不仅没能够表白，还娶了吴慕榕为妻。 李时珍发现当今世上的医书错误连连漏洞百出，于是起了编撰《本草纲目》的念头。然而，他却因为个性过于耿直而得罪了权贵，使得他不得不暂时中断了医书的编撰，还性命不保踏上了逃亡的旅途。所幸有太医院的庞宪（马国明 饰）一路帮助扶持，李时珍终于完成了旷世奇作《本草纲目》。
