大家继续探索孤岛的秘密，寻找脱身方法，没想到的是，岛上竟然存在组织严密、早就在此生活的“其他人”。“其他人”将杰克（马修·福克斯 Matthew Fox 饰）、凯特（伊万杰琳·莉莉 Nicole Evangeline Lilly 饰）、索亚（詹姆斯·福特 James F  ord 饰）抓进了监狱， 他们设法逃脱，帮助杰克逃脱的是“其他人”中一个叫朱丽叶特的女人（伊丽莎白·米切尔 Elizabeth Mitchell 饰），她跟着杰克来到营地，又揭露了岛上存在过的“达摩计划”，而今“其他人”的领导者本（迈克尔·爱默生 Michael Emerson 饰）正是曾摧毁“达摩计划”的人。朱丽叶特到达营地，似乎带着本赋予她的使命，即带走幸存者中的孕妇……

　　The stranded Colonials struggle to survive under the brutal Cylon rule of New Caprica, but when Galactica returns to save humanity, the fledgling Fleet resumes its search for Earth. The Cylons, after losing control on New Caprica, depart on their own mysterious quest for Earth.

　　在神秘的南极冰层里，发掘出星际之门建造者遗弃的基地。星际之门亚特兰蒂斯小队应召执行一次冒险性最大的星际之门任务——前往遥远的天马星系。
　　亚特兰蒂斯小队遭遇古代人类文明的袭击...包括不断威胁人类生命无处不在的新敌人——The Wraith.
　　Elizabeth Weir博士是亚特兰蒂斯小队的队长，她是一个外交关系专家。她拥有出色的政治才能，但在军事上喜欢虚张声势，在军队里面担任少校之职。John Sheppard是一个天资聪颖的驾驶员。陆军少尉Aiden Ford担任副驾驶员，他是一个年轻热情的军官。Rodney McKay博士是一个聪明机智的天体物理学家，曾在星际之门司令部任职。飞船上还有一位朋友——Teyla，她是天马星系Arhosian人年轻漂亮的领袖，与亚特兰蒂斯小队一起跟The Wraith战斗。
　　在新的一季中加入了许多新面孔，他们之中最引人注意的是Ronan Dex，一个为了捍卫自己的星球而与The Wraith抗争7年的天马星系人。还有地球最新型的银河战斗巡洋舰Daedalus--代达罗斯号的司令官，Steven Caldwell上校。
　　新的一季新的冒险，Atlantis的冒险再度归来，带领你探索深奥的宇宙.

在神秘的南极冰层里，发掘出星际之门建造者遗弃的基地。星际之门亚特兰蒂斯小队应召执行一次冒险性最大的星际之门任务——前往遥远的天马星系。亚特兰蒂斯小队遭遇古代人类文明的袭击...包括不断威胁人类生命无处不在的新敌人——The Wraith.Elizabeth Weir博士是亚特兰蒂斯小队的队长，她是一个外交关系专家。她拥有出色的政治才能，但在军事上喜欢虚张声势，在军队里面担任少校之职。John Sheppard是一个天资聪颖的驾驶员。陆军少尉Aiden Ford担任副驾驶员，他是一个年轻热情的军官。Rodney McKay博士是一个聪明机智的天体物理学家，曾在星际之门司令部任职。飞船上还有一位朋友——Teyla，她是天马星系Arhosian人年轻漂亮的领袖，与亚特兰蒂斯小队一起跟The Wraith战斗。在新的一季中加入了许多新面孔，他们之中最引人注意的是Ronan Dex，一个为了捍卫自己的星球而与The Wraith抗争7年的天马星系人。还有地球最新型的银河战斗巡洋舰Daedalus--代达罗斯号的司令官，Steven Caldwell上校。新的一季新的冒险，Atlantis的冒险再度归来，带领你探索深奥的宇宙.

第六季故事为第五季结束时，萨德侵占莱克斯的身体，并灌输他跟克拉克一样的超能力，还释放一种病毒到地球。