少林俗家弟子石燕侠偷了少林寺镇寺之宝达摩剑，只身来到边关大漠黄土岭，投店东京客栈，遭大漠匪贼钱多多暗算，背负骂名偷来的达摩剑落入钱多多之手。钱多多勾结官府县令胡瓜，抢劫过往商人祸害一方，石燕侠决定会会...

蜀山群山之中的昆仑山，掌门孤月大师（张柏芝饰）与徒弟玄天宗（郑伊健饰）相恋，事先预感邪恶的幽泉血魔会进攻昆仑，自知无力抵抗的她，为保天宗性命而借故赶他下山，并将昆仑秘藏武器“日月金轮”交付天宗，而自己则为血魔所杀，昆仑山灵气尽被吸去。                                    
                               二百年后，邪恶力量再次侵犯正派，峨嵋开山祖师峨嵋真人（洪金宝饰），惟恐此战伤及凡间，乃派大弟子丹辰子（古天乐饰）前往山下疏离凡间正在交战的军队，在途中与程乐天（章子怡饰）、玄天宗相遇，却意外发现血魔的秘密，并因而落入陷阱。在生死之际峨嵋真人率弟子前来救援，玄天宗赫然发现其中一名女弟子李英奇（张柏芝饰），样子竟酷似师傅孤月大师。同时，峨嵋真人发觉中了血魔诡计，一场更为凶险的正邪大战即将展开……

清末，太监总管李莲英授意义和团内神打、茅山、术士三坛清除叛徒二舵主雷公（刘家良饰）。神打坛方少卿（惠英红饰）与师叔（刘家辉饰），茅山坛雷勇（刘家荣饰），术士坛铁猴（小侯饰）、铁坛主（朱铁和饰）分头南下广州，寻觅雷公下落。当年雷公掌管云南分舵，因不愿见弟子凭借所谓“神打”功夫抵抗洋人军火徒然丧命，不惜违背朝廷旨意，将义和团云南分舵解散，化名雨伯隐居乡间。三坛之追杀人马皆有争功之心，暗斗不止。雷勇更用无赖（傅声饰）乔装雷公以引出真身。方少卿与铁猴先后为雷公大义感动转变阵营，但三坛坛主仍欲置雷公与死地。